Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrcc1Q69ZB0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrcc1Q69ZB0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms