Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf280dQ68FE8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms