Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fnip1Q68FD7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fnip1Q68FD7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms