Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrp4eQ66X19 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nlrp4eQ66X19 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nlrp4eQ66X19 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms