Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccdc18Q640L5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ccdc18Q640L5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
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