Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms