Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms