Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20865Q62460 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms