Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxa13Q62424 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
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