Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tff3Q62395 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tff3Q62395 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Tff3Q62395 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Tff3Q62395 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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