Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Supt6hQ62383 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt6hQ62383 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1014.6 ms