Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrhQ62361 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrhQ62361 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrhQ62361 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrhQ62361 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrhQ62361 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TrhQ62361 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms