Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms