Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms