Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4bQ62179 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema4bQ62179 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema4bQ62179 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema4bQ62179 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms