Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms