Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg2Q61878 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg2Q61878 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg2Q61878 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg2Q61878 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg2Q61878 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg2Q61878 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg2Q61878 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg2Q61878 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg2Q61878 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg2Q61878 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg2Q61878 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prg2Q61878 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prg2Q61878 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prg2Q61878 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prg2Q61878 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms