Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nell2Q61220 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms