Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms