Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms