Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinQ61043 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinQ61043 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinQ61043 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinQ61043 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinQ61043 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinQ61043 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinQ61043 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinQ61043 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinQ61043 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NinQ61043 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NinQ61043 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NinQ61043 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NinQ61043 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NinQ61043 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NinQ61043 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NinQ61043 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NinQ61043 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NinQ61043 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NinQ61043 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NinQ61043 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NinQ61043 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NinQ61043 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NinQ61043 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NinQ61043 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NinQ61043 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NinQ61043 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NinQ61043 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NinQ61043 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NinQ61043 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NinQ61043 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NinQ61043 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NinQ61043 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NinQ61043 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NinQ61043 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NinQ61043 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NinQ61043 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NinQ61043 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NinQ61043 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NinQ61043 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NinQ61043 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NinQ61043 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NinQ61043 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NinQ61043 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NinQ61043 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NinQ61043 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NinQ61043 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NinQ61043 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NinQ61043 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NinQ61043 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NinQ61043 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NinQ61043 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NinQ61043 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NinQ61043 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NinQ61043 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NinQ61043 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NinQ61043 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NinQ61043 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NinQ61043 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NinQ61043 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NinQ61043 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinQ61043 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinQ61043 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinQ61043 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinQ61043 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinQ61043 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinQ61043 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinQ61043 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinQ61043 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinQ61043 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinQ61043 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinQ61043 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinQ61043 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinQ61043 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NinQ61043 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinQ61043 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NinQ61043 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinQ61043 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinQ61043 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NinQ61043 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinQ61043 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinQ61043 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinQ61043 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NinQ61043 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinQ61043 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NinQ61043 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinQ61043 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinQ61043 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinQ61043 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinQ61043 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NinQ61043 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinQ61043 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinQ61043 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinQ61043 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinQ61043 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinQ61043 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinQ61043 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinQ61043 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NinQ61043 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinQ61043 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms