Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms