Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna1Q60960 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms