Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r1bQ60829 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms