Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf3Q60803 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms