Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a1Q60737 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms