Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samhd1Q60710 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Samhd1Q60710 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Samhd1Q60710 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samhd1Q60710 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samhd1Q60710 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Samhd1Q60710 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Samhd1Q60710 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samhd1Q60710 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms