Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms