Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sik1Q60670 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms