Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms