Protein–RNA interactions for Protein: Q60604

Scin, Adseverin, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScinQ60604 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ScinQ60604 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScinQ60604 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScinQ60604 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScinQ60604 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScinQ60604 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScinQ60604 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScinQ60604 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScinQ60604 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScinQ60604 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScinQ60604 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScinQ60604 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScinQ60604 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScinQ60604 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScinQ60604 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScinQ60604 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ScinQ60604 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ScinQ60604 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms