Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CttnQ60598 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CttnQ60598 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CttnQ60598 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CttnQ60598 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CttnQ60598 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CttnQ60598 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CttnQ60598 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CttnQ60598 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CttnQ60598 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CttnQ60598 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms