Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnajc11Q5U458 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms