Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Specc1Q5SXY1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms