Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms