Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zzef1Q5SSH7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms