Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRX1

Tom1l2, TOM1-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l2Q5SRX1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1l2Q5SRX1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tom1l2Q5SRX1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1l2Q5SRX1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms