Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm6bQ5NCY0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm6bQ5NCY0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm6bQ5NCY0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms