Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC97

Vmn1r209, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r209Q5NC97 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r209Q5NC97 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r209Q5NC97 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms