Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnni3kQ5GIG6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms