Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ecm2Q5FW85 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ecm2Q5FW85 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ecm2Q5FW85 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ecm2Q5FW85 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ecm2Q5FW85 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ecm2Q5FW85 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ecm2Q5FW85 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ecm2Q5FW85 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ecm2Q5FW85 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ecm2Q5FW85 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ecm2Q5FW85 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ecm2Q5FW85 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ecm2Q5FW85 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ecm2Q5FW85 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ecm2Q5FW85 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms