Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrig2Q52KR2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms