Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms