Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc84Q4VA36 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms