Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx49Q4FZF3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms