Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf38aQ4FK66 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms