Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Brinp3Q499E0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brinp3Q499E0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms