Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp235Q499D5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp235Q499D5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms