Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec4Q497M3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec4Q497M3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms