Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms